Connor Kenway - nascido Ratohnhaké:ton - é um mestiço de pai britânico (de onde vem sua descendencia de Altair Ibn La' Ahad e de Ezio Auditore da Firenze) e mãe indígena, criado na tribo dos Mohawks que é atraído para a luta contra a tirania, quando a sua tribo é atacada por colonos brancos.O jogo irá decorrer entre 1753 e 1783,onde a guerra entre A Irmandade dos Assassinos e a Ordem dos Cavaleiros Templários se mudou para a América Colonial e é focada na vida de Connor em grandes momentos da história americana como a Guerra dos Sete Anos e aRevolução Americana, sendo a ultima a guerra de independência na qual os Estados Unidos se libertaram do domínio britânico.Será mostrado um lado mais balanceado da eterna guerra com os templários, pois, de acordo com a Ubisoft, eles (os templários) não são “os bandidos“, e realmente acreditam que estão fazendo a coisa certa. O jogador irá interagir com figuras históricas incluindo George Washington, Benjamin Franklin, Thomas Jefferson, Israel Putnam, Marquês de La Fayette, John Pitcairn, William Prescott, e Charles Lee, participando em grandes momentos da história americana, como o Grande Incêndio de Nova Iorque (1776) ou o Inverno de Vale Forge. A história terá uma duração de 30 anos de vida de Connor.
Assassin's Creed III ocorre em mundo aberto com jogabilidade não-linear, fortemente influênciado pelo free running, onde o principal foco do jogador é usar habilidade de stealth para realizar assassinatos e saqueamentos da forma mais discreta possível. Uma adição em relação aos jogos anteriores da série é a possibilidade de subir e se esconder em arvores, além de se pendurar em cipós e cordas, o que não era possível até Revelations.
Uma grande novidade no jogo é um novo sistema de caça, que permite ao jogador caçar animais selvagens, para que sua pele seja trocada por dinheiro.O sistema de comércio e propriedade do jogo continua presente, permitindo ao jogador reformar partes destruídas e abandonadas da cidade, além de comprar novos equipamentos e vestimentas em lojas como ferreiros e artesões.
